علم السكريات

علم السكريات Glycomics، هو الدراسة الشاملة للسكريات (مجموعة السكريات الكاملة، سواء الحرة أو الموجودة ضمن جزيئات العضية الأكثر تعقيداً)، بما يشمل الجوانب الوراثية، الفسيولوجية، المرضية، وغيرها.[1][2] علم السكريات "هي دراسة منهجية لجميع البنى الگليكانية للخلية أو العضية المعنية" وهو أحد فروع علم أحياء السكريات.[3]

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

التحديات

  • تعقيد السكريات: فيما يخص تركيباتها، فالسكريات ليست خطية لكنها شديدة التفرع. علاوة على ذلك، يمكن أن تخضع الگليكانات للتعديل (سكريات معدلة)، مما يزيد من تعقيدها.
  • المسارات الاصطناعية الحيوية المعقدة للگليكانات.
  • عادة ما توجد الگليكانات سواء مرتبطة بالپروتين (پروتين سكري أو مرافقة للدهون دهون سكرية).
  • على عكس السكريات، فالگليكانات أكثر ديناميكية.
  • Unlike genomes, glycans are highly dynamic.


الأهمية

للإجابة على السؤال ينبغي معرفة الوظائف المختلفة والهامة للگليكانات. وفيما يلي بعض من هذه الوظائف:


الأدوات المستخدمة

فيما يلي أمثلة على التقنيات الشائعة المستخدمة في تحليل الگليكانات[3][4]


قياس الطيف الكتلي عالي الدقة (MS) كروماتوگرافيا السوائل عالية الأداء (HPLC)

مراقبة التفاعل المتعدد (MRM)

جدول 1:مزايا وعيوب قياس الطيف الكتلي في تحليل الگليكانات

المزايا العيوب
  • تطبق على كميات العينات الصغيرة (أقل من fmol)
  • مفيدة لخليط الگليكان المعقد (توليد بعد تحليلي مزيد).
  • Attachment sides can be analysed by tandem MS experiments (side specific glycan analysis).
  • Glycan sequencing by tandem MS experiments.
  • طريقة تدميرية.
  • تحتاج إلى تصميم تجريبي مناسب.

المصفوفات

وضع العلامات الأيضية والترادفية للگليكان

أدوات للپروتينات السكرية

البرمجيات وقواعد البيانات

هناك الكثير من برمجيات وقواعد بيانات أبحاث علم السكريات متوافرة على الإنترنت، وتشمل:

انظر أيضاً

المصادر

[5]

  1. ^ Aoki-Kinoshita KF; Lewitter, Fran (May 2008). Lewitter, Fran (ed.). "An Introduction to Bioinformatics for Glycomics Research". PLoS Comput. Biol. 4 (5): e1000075. doi:10.1371/journal.pcbi.1000075. PMC 2398734. PMID 18516240.{{cite journal}}: CS1 maint: unflagged free DOI (link)
  2. ^ Srivastava S (May 2008). "Move over proteomics, here comes glycomics". J. Proteome Res. 7 (5): 1799. doi:10.1021/pr083696k. PMID 18509903.
  3. ^ أ ب Essentials of Glycobiology (2nd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2009. ISBN 978-087969770-9.
  4. ^ خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صحيح؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة :0
  5. ^ Maverakis E, Kim K, Shimoda M, Gershwin M, Patel F, Wilken R, Raychaudhuri S, Ruhaak LR, Lebrilla CB (2015). "Glycans in the immune system and The Altered Glycan Theory of Autoimmunity". J Autoimmun. 57 (6): 1–13. doi:10.1016/j.jaut.2014.12.002. PMC 4340844. PMID 25578468.

وصلات خارجية