علم السكريات
علم السكريات Glycomics، هو الدراسة الشاملة للسكريات (مجموعة السكريات الكاملة، سواء الحرة أو الموجودة ضمن جزيئات العضية الأكثر تعقيداً)، بما يشمل الجوانب الوراثية، الفسيولوجية، المرضية، وغيرها.[1][2] علم السكريات "هي دراسة منهجية لجميع البنى الگليكانية للخلية أو العضية المعنية" وهو أحد فروع علم أحياء السكريات.[3]
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
التحديات
- تعقيد السكريات: فيما يخص تركيباتها، فالسكريات ليست خطية لكنها شديدة التفرع. علاوة على ذلك، يمكن أن تخضع الگليكانات للتعديل (سكريات معدلة)، مما يزيد من تعقيدها.
- المسارات الاصطناعية الحيوية المعقدة للگليكانات.
- عادة ما توجد الگليكانات سواء مرتبطة بالپروتين (پروتين سكري أو مرافقة للدهون دهون سكرية).
- على عكس السكريات، فالگليكانات أكثر ديناميكية.
- Unlike genomes, glycans are highly dynamic.
الأهمية
للإجابة على السؤال ينبغي معرفة الوظائف المختلفة والهامة للگليكانات. وفيما يلي بعض من هذه الوظائف:
- الپروتينات السكرية الموجودة على سطح الخلية تلعب دوراً حيوياً في التجلية الميكروبية والڤيروسية.
- لها دور في مسارات الإشارة الخلوية تعديل وظيفة الخلية.
- تلعب دوراً هاماً في المناعة الفطرية.
- تحدد تطور السرطان.
- تنسق المصير الخلوي، تثبط التكاثر الخلوي، وتنظم الدوران والغزو.
- تؤثر على استقرار وطي اللپروتينات.
- تؤثر على مسار ومصير الپروتينات السكرية.
- هناك الكثير من الأمراض المرتبطة بالگليكانات، وعادة ما تكون أمراض وراثية.
الأدوات المستخدمة
فيما يلي أمثلة على التقنيات الشائعة المستخدمة في تحليل الگليكانات[3][4]
قياس الطيف الكتلي عالي الدقة (MS) كروماتوگرافيا السوائل عالية الأداء (HPLC)
مراقبة التفاعل المتعدد (MRM)
جدول 1:مزايا وعيوب قياس الطيف الكتلي في تحليل الگليكانات
| المزايا | العيوب |
|---|---|
|
|
المصفوفات
وضع العلامات الأيضية والترادفية للگليكان
أدوات للپروتينات السكرية
البرمجيات وقواعد البيانات
هناك الكثير من برمجيات وقواعد بيانات أبحاث علم السكريات متوافرة على الإنترنت، وتشمل:
انظر أيضاً
المصادر
- ^ Aoki-Kinoshita KF; Lewitter, Fran (May 2008). Lewitter, Fran (ed.). "An Introduction to Bioinformatics for Glycomics Research". PLoS Comput. Biol. 4 (5): e1000075. doi:10.1371/journal.pcbi.1000075. PMC 2398734. PMID 18516240.
{{cite journal}}: CS1 maint: unflagged free DOI (link) - ^ Srivastava S (May 2008). "Move over proteomics, here comes glycomics". J. Proteome Res. 7 (5): 1799. doi:10.1021/pr083696k. PMID 18509903.
- ^ أ ب Essentials of Glycobiology (2nd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2009. ISBN 978-087969770-9.
- ^ خطأ استشهاد: وسم
<ref>غير صحيح؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة:0 - ^ Maverakis E, Kim K, Shimoda M, Gershwin M, Patel F, Wilken R, Raychaudhuri S, Ruhaak LR, Lebrilla CB (2015). "Glycans in the immune system and The Altered Glycan Theory of Autoimmunity". J Autoimmun. 57 (6): 1–13. doi:10.1016/j.jaut.2014.12.002. PMC 4340844. PMID 25578468.
وصلات خارجية
- National Center for Functional Glycomics (NCFG)
- Glycomics - Glycan Recognizing Proteins
- List of Glycomics web sites
- Glycomics Portal at CCRC, Software for glycomics
- Functional Glycomics Gateway, a collaboration between the Consortium for Functional Glycomics and Nature Publishing Group
- glycosciences.de This site provides databases and bioinformatics tools for glycobiology and glycomics.
- GlycomeDB, A carbohydrate structure metadatabase
- EuroCarbDB[dead link]
- GlycoBase A web HPLC/UPLC resource that contains elution positions expressed as glucose unit values.
- ProGlycAn A short introduction to glycan analysis and a nomenclature for N-Glycans
- Emanual Maverakis; et al. "Glycans in the immune system and The Altered Glycan Theory of Autoimmunity" (PDF).
{{cite web}}: Explicit use of et al. in:|author=(help)
| علم الجينات | |
|---|---|
| معلوماتية حيوية | |
| علم الأحياء البنيوي | |
| أدوات بحثية | |
| منظمات | |
