پب كم
المحتوى | |
---|---|
الوصف | Chemicals and their bioassays |
العضيات | Humans and other animals |
الاتصال | |
مركز الأبحاث | NCBI |
المرجع الأولي | 15879180 |
الولوج | |
الموقع الإلكتروني | https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ |
رابط التحميل | FTP |
رابط خدمة الوب | PUG-View[1] |
Tools | |
متفرقات | |
License | Public domain |
پب كم Pub Chem هي قاعدة بيانات للجزيئات الكيميائية. يقوم المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (National Center for Biotechnology Information) بإدارة على بوب كيم، وهو جزء من المكتبة الوطنية للطب التي هي جزء من المعهد الوطني للصحة في الولايات المتحدة. يمكن الدخول إلى بوب كيم مجانا باستخدام واجهة المستخدم عبر شبكة الإنترنت حيث يوجد الملايين من البنى الهيكلية والبيانات الوصفية التي يمكن تحميلها مجانا باستخدام بروتوكول نقل الملفات FTP. ويتضمن بوب كيم وصفا للمواد والجزيئات الصغيرة الحاوية على أقل من 1000 ذرة و 1000 رابطة. حاولت جمعية الكيميائيين الأمريكية مع الكونغرس الأمريكي للحد من تشغيل بوب كيم لأنها تنافس خدمة الخلاصات الكيميائية. يساهم أكثر من 80 بائع لقاعدة البيانات في زيادة قاعدة بيانات بوب كيم.
Example (Lipinski's Rule of Five):
0:500[mw] 0:5[hbdc] 0:10[hbac] -5:5[logp]
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Database fields
Identification numbers | ||
• | Identification number in current database | [UID] |
• | Substance identification number | [SID] |
• | Compound identification number | [CID] |
• | BioAssay identification number | [BAID], [AID] |
General | ||
• | Any database field | [ALL] |
• | Comment | [CMT] |
• | Deposition date | [DDAT], [DEPDAT] |
• | Depositor's external ID | [SRID], [SRCID] |
• | Source name | [SRC], [SRCNAM], [SRCNAME] |
• | Source release date | [SRD], [SRDAT], [RLSDAT] |
• | Medical Subject Heading (MeSH) term | [MSHT], [MESHT] |
• | MeSH tree node | [MSHN], [MESHTN] |
• | MeSH pharmacological actions | [PHMA], [PHARMA] |
Substance properties | ||
• | Substance synonyms | [SYNO] |
• | IUPAC name | [UPAC], [IUPAC] |
• | International Chemical Identifier (InChI) | [INCHI] |
• | Molecular weight | [MW], [MWT], [MOLWT] |
• | Chemical elements | [ELMT], [EL] |
• | Non-Hydrogen atoms | [HAC], [HACNT] |
• | Isotope count | [IAC], [IACNT] |
• | Total formal charge | [TFC], [CHG], [CHRG] |
• | Chiral atom count | [ACC], [ACCNT] |
• | Defined chiral atom count | [ACDC], [ACDCNT] |
• | Undefined chiral atom count | [ACUC], [ACUCNT] |
• | Hydrogen bond acceptor count | [HBAC], [HBACNT] |
• | Hydrogen bond donor count | [HBDC], [HBDCNT] |
• | Tautomer count | [TC], [TCNT], [TTMC] |
• | Rotatable bond count | [RBC], [RBCNT] |
• | XLogP[2] | [XLGP], [LOGP] |
Compound properties | ||
• | Compound synonyms | [CSYN], [CSYNO] |
• | Component count | [CC], [CCNT] |
• | Covalent unit (molecule) count | [CUC], [CUCNT] |
• | Total bioactivity count | [TAC] |
انظر أيضاً
- قاعدة بيانات كيميائية
- CAS Common Chemistry - run by the American Chemical Society
- Comparative Toxicogenomics Database - run by North Carolina State University
- ChEMBL - run by European Bioinformatics Institute
- ChemSpider - run by UK's Royal Society of Chemistry
- DrugBank - run by the University of Alberta
- IUPAC - run by Swiss-based International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC)
- Moltable - run by India's National Chemical Laboratory
- PubChem - run by the National Institute of Health, USA
- BindingDB - run by the University of California, San Diego
- SCRIPDB - run by the University of Toronto, Canada
- National Center for Biotechnology Information (NCBI) - run by the National Institute of Health, USA
- Entrez - run by the National Institute of Health, USA
- GenBank - run by the National Institute of Health, USA
المراجع
- ^ Kim, Sunghwan; Thiessen, Paul A.; Cheng, Tiejun; Zhang, Jian; Gindulyte, Asta; Bolton, Evan E. (9 August 2019). "PUG-View: programmatic access to chemical annotations integrated in PubChem". Journal of Cheminformatics. 11 (1): 56. doi:10.1186/s13321-019-0375-2. PMC 6688265. PMID 31399858.
- ^ Cheng T (Nov 2007). "Computation of octanol-water partition coefficients by guiding an additive model with knowledge". Journal of Chemical Information and Modeling. 47 (6): 2140–2148. doi:10.1021/ci700257y. PMID 17985865.
وصلات خارجية
Site officiel الموقع الرسمي