جزيرة جينومية
الجزيرة الجينومية genomic island (اختصاراً GI)، هي جزء من الجينوم الذي يملك الدليل على الأصول الأفقية.[1] عادة ما يستخدم هذا المصطلح في علم الأحياء الدقيقة، خاصة عند الإشارة إلى البكتريا. يمكن للجزيرة الجينومية أن ترمز للكثير من الوظائف، يكنها أن تشارك في التكافل أو الإمراض، وقد تساعد على تكيف العضية. الكثير من الأنواع الفرعية للجزر الجينومية الموجودة تعتمد على الوظيفة التي تقدمها. على سبيل المثال، الجزيرة الجينومية المرتبطة بالإمراض عادة ما يطلق عليها اسم جزيرة قدرة على الإمراض، بنيما الجزر الجينومية التي تحتوي على الكثير من الجينات المقاومة للمضادات الحيوية يشار إليها بالجزر المقاومة للمضادات الحيوية. قد تحدث بعض الجزر الجينومية في أنواع بعيدة الارتباط كنتيجة لأنواع مختلفة من التحول الجيني الظاهري (الاستحالة، الاقتران، الاستضاحة). يمكن تحديد هذا عن طريق تحليل التكوين القاعدي، فضلاً عن تقديرات تطور السلالات.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
التنبؤ الحاسوبي
أمثلة
في البكتريا، الكثير من أنظمة الإفراز الثلاثي وأنظمة الإفراز الرباعي تقع في مناطق داخل الدنا تسمى بالجزر الجيونمية. تتميز "الجزر" الثلاثة بحجمها الكبير (>10 ك.ق)، يرتبط ترددها بجينات ترميز-tRNA ومحتوى G+C المختلف مقارنة ببقية الجينوم. الكثير من الجزر الجينومية تحيط بها هياكل تكرار وتحمل شظايا من العناصر الناقلة الأخرى مثل العاثيات والپلازميدات. بعض الجزر الجينومية يمكنها إستئصال نفسها عفوياً من الكروموسوم ويمكنها الانتقال إلى مسقبلات مناسبة أخرى.[بحاجة لأمثلة]
انظر أيضاً
المصادر
- ^ Langille, MG; Hsiao, WW; Brinkman, FS (May 2010). "Detecting genomic islands using bioinformatics approaches". Nature Reviews. Microbiology. 8 (5): 373–82. doi:10.1038/nrmicro2350. PMID 20395967.