العتائق
العتائق Archaea Temporal range: Paleoarchean أو ربما Eoarchean – الحاضر
| |
---|---|
Halobacteria sp. strain NRC-1, each cell about 5 μm long | |
التصنيف العلمي | |
Domain: | Archaea |
ممالك وشُعب | |
عتائق ربيعية |
العتائق[1] أو البَدْئِيَات[2] أو الأًصليات ( الجراثيم العتيقة أو الجراثيم الأصلية ) Archaea تشكل شعبة أساسية من الأحياء الدقيقة مثل البكتيريا ، الأصليات كائنات وحيدة الخلية لا تحوي نواة خلوية فهي من ضمن بدائيات النوى . تصنف عادة على انها ضمن مملكة مونيرا التصنيف الحيوي خماسي الممالك. مع ذلك لا يوجد تأكيد على تقارب وراثي عرقي للمجموعات فيه ، في نظام التصنيف ثلاثي الممالك : تعتبر التصنيفات الرئيسية هي الأصليات و البكتيريا و حقيقيات النوى Eukaryota . لكن بالرغم من أنها بدائية النوى فإن الأصليات تعتبر أقرب لحقيقيات النوى منها إلى البكتيريا. لدلك يتم وضع الأصليات و حقيقيات النوى في مجموعة واحدة ضمن كليد أو مجموعة مشتركة الأصل clade تدعى نيومورا Neomura ، يعتقد انها نشأت أساسا من البكتريا موجبة الگرام. توصف الأصليات بأنها من محبات الشروط الصعبة extremophile تعيش في بيئات قاسية . لكنها تتواجد في جميع الأماكن.
الكائن الوحيد من هذه المجمعة يدعى أصيلي أو أرخياني "archaean." ، الاسم الإنكليزي اتى من الإغريقية : (αρχαία) بمعنى "الفرد القديم" "ancient ones"; مفردها Archaeum, Archaean, or Archaeon : تدعى أيضا بكتريا أصلية أو بكتريا قديمة Archaeobacteria ، وهي مجموعة من الكائنات بدائية النواة (بروكاريوتا) Prokaryota، وتمثل إحدى قبائل المملكةالحية. توجد غالبا في بيئات غير عادية، مثل الينابيع الحارة.[3]
الأركيا، وتسمى أيضًا الجراثيم البدائية، مجموعة من الكائنات الحية وحيدة الخلية التي تشكل واحدًا من ثلاثة أقسام أساسية للحياة. والنوعان الآخران من الكائنات الحية هما حقيقية النواة، التي تشتمل على الحيوانات والنباتات، والجراثيم الحقيقية، التي تتضمن معظم الكائنات الحية التي تسمى بصورة عامة جراثيم. وتتميز الكائنات حقيقية النواة بأن لها خلايا حقيقية النواة، أو خلايا ذات نواة، بينما تتميز الجراثيم الحقيقية والأركيا بأن لها خلايا بدائية النواة، أو خلايا تفتقر إلى النواة. لقد قام العلماء في الماضي بتصنيف الأركيا مع الجراثيم الحقيقية، لأن تركيبات الخلايا لديها متماثلة. ولكن بدءًا من سبعينيات القرن العشرين، كشف التحليل الدقيق لجيناتها، أن الأركيا والجراثيم الحقيقية يختلفان كثيرًا بحيث لا يمكن تصنيفهما معًا. وتتشابه الأركيا، في العديد من الوجوه، مع الكائنات حقيقية النواة، أكثر من تشابهها مع الجراثيم الحقيقية.
وتصنف الأركيا ضمن أقدم أشكال الحياة على الأرض. لقد استطاعت الأركيا أن تنمي بعض الخصائص غير المعتادة. على سبيل المثال، باستطاعة العديد من أنواع الأركيا، استهلاك حمض الخل أو الهيدروجين، أو الكبريت. كما أن بعض أنواع الأركيا تستطيع أن تنتج غاز الميثان. وطورت أنواع أخرى شكلاً غير معتاد من أشكال التركيب الضوئي، وهو عملية تستخدمها لصنع الطعام. وعلى عكس التركيب الضوئي في النباتات والجراثيم، فإن التركيب الضوئي الخاص بالأركيا لا يستخدم خضاب الكلوروفيل (اليخضور).
تعيش الأركيا في مختلف أنواع البيئات، ويعيش العديد منها تحت ظروف قاسية في أماكن مثل آبار النفط، ومنافذ المياه الحارة (الينابيع الساخنة) في أعماق البحار، والبيئات اللاحيوائية (الخالية من الأوكسيجين). وتنمو بعض أنواع الأركيا الأخرى في التربة وداخل أجسام العديد من الكائنات الحية. فهناك العديد من الأبقار، والنمل الأبيض، وحتى الناس، الذين تعيش الأركيا داخل أجهزتهم الهضمية دون أن تسبب لهم أي ضرر.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
التصنيف
نطاق جديد
التصنيف الحالي
- مقالات مفصلة: تصنيف علمي
- Systematics
الأنواع
الأصل والتطور
- مقالة مفصلة: خط زمني للتطور
مقارنة مع نطاقات أخرى
يصف الجدول التالي بعض السمات الرئيسية التي تتشارك عموماً، أو لا تتشارك، فيها العتائق مع النطاقين الآخرين، لتوضيح العلاقات بينهم.[5] العديد من تلك السمات ستُناقـَش أدناه.
مشتركة مع البكتريا | مشتركة مع حقيقيات النوى | مميزة للعتائق |
---|---|---|
لا نواة ولا عضيات داخل غشاء | لا peptidoglycan | بنية جدار الخلية (فعلى سبيل المثال، بعض جدران خلايا العتائق تحتوي على pseudomurein) |
Circular genome | DNA associated with histones[6][7] | Cell membrane containing ether-linked lipids |
Genes grouped in operons | الترجمة تبدأ بالـ methionine | Flagellin protein structure[8] |
No introns or RNA processing | Similar RNA polymerase, promoters, other transcriptional machinery[8][9][10] | Ribosomal structure (سمة مشتركة مع كل من البكتريا وحقيقيات النوى) |
Polycistronic mRNA | Similar DNA replication and repair[11] | tRNA sequence and metabolism[8][12] |
حجم الخلية (>100-ضعف أصغر من حقيقيات النوى) | Similar ATPase (Type V) | لا إنزيم fatty acid synthetase[8] |
العلاقة مع بدائيات النوى الأخرى
العلاقة مع حقيقيات النوى
مورفولوجيا
الهيكل، تطور التكوين، العلمية
الأغشية
الجدار والأسواط
- مقالة مفصلة: جدار الخلية
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
التمثيل الغذائي
- مقالة مفصلة: الأيض الجرثومي
نوع التغذية | مصدر الطاقة | مصدر للكربون | أمثلة |
---|---|---|---|
Phototrophs | ضوء الشمس | مركبات عضوية | Halobacteria |
Lithotrophs | مركبات غير عضوية | مركبات عضوية أو carbon fixation | Ferroglobus, Methanobacteria أو Pyrolobus |
Organotrophs | مركبات عضوية | Organic compounds or carbon fixation | Pyrococcus, Sulfolobus أو Methanosarcinales |
الوراثة
التكاثر
- مقالة مفصلة: تكاثر لا جنسي
البيئة
المواطن
الدورة الكيميائية
- مقالة مفصلة: Biogeochemical cycle
التفاعلات مع غيرها من الكائنات
- مقالة مفصلة: تفاعل حيوي
التنافع
المطاعمة
أهميتها في التكنولوجيا والصناعة
- مقالة مفصلة: التكنولوجيا الحيوية
انظر أيضا
- قائمة أنواع العتائق المنشورة والمقبولة
- انتاج الميثان الهوائي
- List of sequenced archaeal genomes
- The Surprising Archaea (كتاب)
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
قراءات للإستزادة
- Howland, John L. (2000). The Surprising Archaea: Discovering Another Domain of Life. Oxford: Oxford University Press. ISBN 0-19-511183-4.
- Martinko JM, Madigan MT (2005). Brock Biology of Microorganisms (11th ed.). Englewood Cliffs, N.J: Prentice Hall. ISBN 0-13-144329-1.
- Garrett RA, Klenk H (2005). Archaea: Evolution, Physiology and Molecular Biology. WileyBlackwell. ISBN 1-4051-4404-1.
- Cavicchioli R (2007). Archaea: Molecular and Cellular Biology. American Society for Microbiology. ISBN 1-55581-391-7.
- Blum P (editor) (2008). Archaea: New Models for Prokaryotic Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-27-1.
{{cite book}}
:|author=
has generic name (help) - Lipps G (2008). "Archaeal Plasmids". Plasmids: Current Research and Future Trends. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-35-6.
- Sapp, Jan (2009). The New Foundations of Evolution. On the Tree of Life. New York: Oxford University Press. ISBN 0-19-538850-X.
- Schaechter, M (2009). Archaea (Overview) in The Desk Encyclopedia of Microbiology, 2nd edition. San Diego and London: Elsevier Academic Press. ISBN 978-0-12-374980-2.
المصادر
المراجع
- ^ القاموس الطبي الموحد.
- ^ مجلة العلوم.
- ^ عبد الجليل هويدي، محمد أحمد هيكل (2004). أساسيات الجيولوجيا التاريخية. مكتبة الدار العربية للكتب.
- ^ Ciccarelli FD, Doerks T, von Mering C, Creevey CJ, Snel B, Bork P (2006). "Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life". Science. 311 (5765): 1283–7. Bibcode:2006Sci...311.1283C. doi:10.1126/science.1123061. PMID 16513982.
{{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link) - ^ Information is from Willey JM, Sherwood LM, Woolverton CJ. Microbiology 7th ed. (2008), Ch. 19 pp. 474–475، إلا إذا ذُكِر غير ذلك.
- ^ Talbert PB, Henikoff S (2010). "Histone variants – ancient wrap artists of the epigenome". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 11: 264–275. doi:10.1038/nrm2861.
- ^ Sandman K, Reeve JN (2006). "Archaeal histones and the origin of the histone fold". Curr. Opin. Microbiol. 9: 520–525. doi:10.1016/j.mib.2006.08.003.
- ^ أ ب ت ث Zillig W (1991). "Comparative biochemistry of Archaea and Bacteria". Curr. Opin. Gen. Dev. 1: 544–551.
- ^ Bell SD, Jackson SP (2001). "Mechanism and regulation of transcription in archaea". Curr. Opin. Microbiol. 4 (2): 208–13. doi:10.1016/S1369-5274(00)00190-9. PMID 11282478.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|month=
ignored (help) - ^ Reeve JN (2003). "Archaeal chromatin and transcription". Mol. Microbiol. 48 (3): 587–98. PMID 12694606.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|month=
ignored (help) - ^ Kelman LM, Kelman Z (2003). "Archaea: an archetype for replication initiation studies?". Mol. Microbiol. 48 (3): 605–15. PMID 12694608.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|month=
ignored (help) - ^ Phillips G, Chikwana VM, Maxwell A; et al. (2010). "Discovery and characterization of an amidinotransferase involved in the modification of archaeal tRNA". J. Biol. Chem. 285 (17): 12706–13. doi:10.1074/jbc.M110.102236. PMC 2857094. PMID 20129918.
{{cite journal}}
: Explicit use of et al. in:|author=
(help); Unknown parameter|month=
ignored (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link) - ^
Based on PDB 1FBB. البيانات منشورة في Subramaniam S, Henderson R (2000). "Molecular mechanism of vectorial proton translocation by bacteriorhodopsin". Nature. 406 (6796): 653–7. doi:10.1038/35020614. PMID 10949309.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|month=
ignored (help) - ^ Xiang X, Chen L, Huang X, Luo Y, She Q, Huang L (2005). "Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus STSV1: virus-host interactions and genomic features". J. Virol. 79 (14): 8677–86. doi:10.1128/JVI.79.14.8677-8686.2005. PMC 1168784. PMID 15994761.
{{cite journal}}
: CS1 maint: multiple names: authors list (link)
وصلات خارجية
عام
- Introduction to the Archaea, ecology, systematics and morphology
- Oceans of Archaea – E.F. DeLong, ASM News, 2003
التصنيف
- NCBI taxonomy page on Archaea
- Genera of the domain Archaea – list of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
- Tree of Life illustration showing how Archaea relates to other lifeforms
- Shotgun sequencing finds nanoorganisms – discovery of the ARMAN group of archaea
الجينوميات
- Browse any completed archaeal genome at UCSC
- Comparative Analysis of Archaeal Genomes (at DOE's IMG system)