نطاق پروتين

Pyruvate kinase, بروتين ذو ثلاث نطاقات (PDB 1PKN).

نطاق بروتين أو مجالات بروتين (بالإنجليزية: protein domain ) هو جزء مكتمل من سلسلة بروتين معين ذات تركيب مجسم (في ثلاثة أبعاد) قد تنشأ، وتكون لها وظيفة حيوية، ويمكنها البقاء منفصلة عن بقية سلسلة البروتين. يكوّن كل نطاق domain من نظام متماسك في ثلاثة أبعاد ويمكنه البقاء مستقرا وقد يتطابق على نفسه. الكثير من البروتينات تكون مكوّنة من نطاقات بنائية. وقد يظهر نطاق معين domain في العديد من البروتينات المختلفة. وتستخدم الجزيئات الكبيرة النطاقات كوحدات بنائية ؛ وترتبط ببعضها البعض بأنظمة مختلفة مكونة بروتينات ذات وظائف مختلفة.

تختلف المجالات (النطاقات) في طولها بين 25 حمض أميني إلى 500 حمض أميني. أقصر النطاقات، مثل "أصابع الزنك" zinc fingers ، يتحقق استقراره بأيونات فلزية أو جسر ثنائي كبريتيد. وكثيراً ما تـُشكـِّل النطاقات وحدات وظيفية، مثل نطاق EF hand الرابط للكالسيوم في كالموديولين. ونظراً لكون النطاقات مستقرة بذاتها وغير معتمدة على بعضها البعض، يمكن استبدال نطاق بنطاق آخر بواسطة الهندسة الوراثية بين بروتين وآخر لإنتاج بروتين كيميري.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

 نطاقات غير معروف وظيفتها (DUFs)

•  مقالة مفصلة: نطاق غير معروف وظيفته

كثير من نطاقات البروتين لا تعرف لها وظيفة ؛ ولهذا تسمى نطاقات لا وظيفية domain of unknown function, DUF . وتوجد تلك النطاقات كثيرا ؛ فمثلا في البكتيريا وجدت نحو 2700 من النطاقات المختلفة ولا تعرف لها وظائف حتى الآن . وفي حقيقيات النوى توجد نحو 1500 من حلبات البروتين ومن ضمنها 800 حلبة بروتين توجد في بكتيريا (بواقع عام : 2013).

وقد قام الباحث " جوداكر" وزملاؤه في عام 2013 بفصل 238 DUFs (eDUFs) ضرورية في البكتيريا ، وقد أدى اقتلاعها من الخلايا إلى موت الخلايا.

 انظر أيضاً

• إشارة تصدير نووي
• بروتين اندماجي
• بروتين
• علم الأحياء
• كيمياء عضوية
• بروتين ثانوي البنية

 وصلات خارجية

 Structural domain databases

• Conserved Domains at the National Center for Biotechnology website
• 3Dee
• CATH
• DALI
• Definition and assignment of structural domains in proteins
• PFAM clan browser

 Sequence domain databases

• InterPro
• Pfam
• PROSITE
• ProDom
• SMART
• NCBI Conserved Domain Database
• SUPERFAMILY Library of HMMs representing superfamilies and database of (superfamily and family) annotations for all completely sequenced organisms

 قواعد بيانات النطاقات الوظيفية

• dcGO قاعدة بيانات شاملة of domain-centric ontologies للوظائف و phenotypes والأمراض.